La Clínica Virgen Guadalupe Cusco, cuenta con las siguientes especialidades:
- Cirugía General
- Traumatología
- Urología
- Otorrinolaringología
- Ginecología
- Pediatría
- Cirugía Plástica
- Neurocirugía
- Oncología
- Cirugía Cardiovascular
- Medicina Interna
- Medicina de Terapia Física y Rehabilitación
- Neurología